九寨沟口附近有很多大大小小的酒店，价格从几十元到上千元不等。旺季相对于淡季来说，价钱有所上涨。尤其是黄金周，一定要提前预定。注意不要轻信住宿拉客的人，自己多找几家比较一下，看好房后可以与服务员谈价。为保护环境，按照规定不允许在沟内住宿，但在树正寨等地方，也有一些藏民家会接纳旅客。
TIP:九寨沟旅游季节性非常强，十月转入淡季之后，即将进入下雪季节，绝大多数食宿站点关闭。如来观赏雪景，一定要联系好住宿的地方。旺季不能二次进沟，淡季(11月16-3月31)可以二次进沟，办理手续需要20元手续费，次日进沟需另购80元观光车票，所以淡季没必要冒险住沟内。
沟外
住在沟外的好处是选择面广，住宿条件较好，餐饮购物方便，有歌舞藏宴等夜生活可以消磨。缺点是离沟口还是有一段距离，须步行或打车过去。 沟口附近的星级宾馆有九寨沟喜来登国际大酒店，天堂洲际大饭店等，价格从二百元到上千元;青年旅舍有草根人家、郎介之家等，价格在30元-80元左右。 自助背包游的话，还是建议选择青旅和藏式客栈，价格实惠，因为九寨沟的星级酒店还是和大城市的没法比。
沟内
为了保护环境，按照规定不允许在景区内住宿，如被抓到要罚款500，并被请出沟。如果坚持住在景区内以便第二天继续游玩，可以尝试与沟内藏民商量住在其家中，但难度也不小，并且景点的游玩要赶在下午4点之前结束，回到藏民家，以躲避巡查。住在沟内的好处是可以近距离感受藏民风俗;缺点是“地下”住宿权益很难受保障，条件简陋，夜生活单调，出门需备手电或头灯。比较出名的有树正寨的石大叔家、宝镜楼等。